Single cell RNA-seq meta-analysis on neurodegenerative disorders (Master thesis)
Καραμήτσου, Κωνσταντίνα/ Karamitsou, Konstantina/ Εφαρμοσμένη Βιοπληροφορική-Ανάλυση Βιολογικών Δεδομένων
Full metadata record
| DC Field | Value | Language |
|---|---|---|
| dc.contributor.author | Καραμήτσου, Κωνσταντίνα | el |
| dc.contributor.author | Karamitsou, Konstantina | en |
| dc.date.accessioned | 2026-07-10T08:52:52Z | - |
| dc.identifier.uri | https://repo.lib.duth.gr/jspui/handle/123456789/22642 | - |
| dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International | * |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ | * |
| dc.subject | Neurodegenerative disorders | en |
| dc.subject | Meta-analysis | en |
| dc.subject | Parkinson’s disease | en |
| dc.subject | Μετα-ανάλυση | el |
| dc.subject | Νευροεκφυλιστικά νοσήματα | el |
| dc.subject | Νόσος του Parkinson | el |
| dc.title | Μετά-ανάλυση single cell RNA-seq σε νευροεκφυλιστικά σύνδρομα | el |
| dc.title | Single cell RNA-seq meta-analysis on neurodegenerative disorders | en |
| heal.type | masterThesis | - |
| heal.generalDescription | Βιβλιογραφία : σ. 42 - 53 | el |
| heal.classification | Nervous system—Degeneration | en |
| heal.dateAvailable | 2029-07-09T21:00:00Z | - |
| heal.language | el | en |
| heal.access | embargo-3 | - |
| heal.recordProvider | Δημοκρίτειο Πανεπιστήμιο Θράκης. Σχολή Επιστημών Υγείας. Τμήμα Μοριακής Βιολογίας και Γενετικής | el |
| heal.publicationDate | 2026-07-06 | - |
| heal.abstract | Τα νευροεκφυλιστικά νοσήματα αποτελούν ασθένειες που χαρακτηρίζονται από τον προοδευτικό εκφυλισμό και τον θάνατο των νευρώνων του εγκεφάλου. Η νόσος του Πάρκινσον είναι μία από τις πιο συχνά εμφανιζόμενες νευροεκφυλιστικές ασθένειες, αναπτύσσεται σε έως και το 3% των ηλικιωμένων ατόμων και χαρακτηρίζεται από τον εκφυλισμό των ντοπαμινεργικών νευρώνων της μέλαινας ουσίας. Η ανάπτυξη της νόσου του Πάρκινσον έχει αποδοθεί σε διάφορους αιτιολογικούς παράγοντες, συμπεριλαμβανομένων της γενετικής προδιάθεσης και περιβαλλοντικών επιρροών. Ωστόσο, παρόλο που πολλά συστήματα και βιολογικές διαδικασίες έχουν συσχετιστεί με τη νόσο, οι ακριβείς εμπλεκόμενοι μοριακοί μηχανισμοί δεν είναι ακόμα ξεκάθαροι. Για τη διερεύνηση μεταγραφωματικών αλλαγών πιθανώς συσχετιζόμενων με τη νόσο, πραγματοποιήθηκε μετά-ανάλυση δεδομένων single-cell και single-nucleus RNA-seq από τον μεσεγκέφαλο ποντικών διαφορετικών μοντέλων της νόσου. Τα αποτελέσματα της ανάλυσης ανέδειξαν διάφορους κυτταρικούς πληθυσμούς του μεσεγκεφάλου υγιών και νοσούντων ποντικών, καθώς και τις μεταβολές στο μεταγραφικό τους προφίλ ως απόκριση στη νόσο. Στα νευρογλοιακά κύτταρα και σε κυτταρικούς πληθυσμούς που εντοπίζονται σε φραγμούς του εγκεφάλου (π.χ. ενδοθηλιακά και επιθηλιακά κύτταρα), οι πιο σημαντικές μεταγραφωματικές αλλαγές αφορούν τη μιτοχονδριακή αναπνοή, τον μεταβολισμό των λιπιδίων και τη λυσοσωμική δραστηριότητα, ενώ οι μεταβολές στους νευρωνικούς πληθυσμούς ήταν λιγότερο έντονες. Συνολικά, η ανάλυση παρέχει πληροφορίες σχετικά με τις κοινές μεταγραφωματικές αλλαγές διαφόρων κυτταρικών τύπων του μεσεγκεφάλου, μεταξύ διαφορετικών μοντέλων ποντικών για τη νόσο του Πάρκινσον. | el |
| heal.abstract | Neurodegenerative disorders are diseases characterized by neuronal death and progressive degeneration in the brain. Parkinson’s disease (PD) is one of the most common neurodegenerative diseases, affecting up to 3% of the elderly population and is marked by dopaminergic neuronal degeneration in the substantia nigra. PD can be attributed to many etiological factors, including genetic predisposition and environmental influences. Yet, its exact molecular pathogenesis remains unknown, with multiple systems and molecular processes appearing implicated. A meta-analysis was conducted on single-cell and single-nucleus RNA-seq data derived from different mouse midbrain models of Parkinson’s disease, in order to investigate potentially disease-related transcriptomic changes. Multiple cell types were identified in the normal and diseased mouse midbrain, with most of them exhibiting transcriptional alterations in response to Parkinson’s disease. The results of the analysis highlighted the involvement of mitochondrial respiratory processes, lipid metabolism and altered lysosomal activity in glial and barrier-associated cell populations, while the neuronal findings were less pronounced. Overall, the analysis provides insights into the convergent transcriptomic findings of multiple midbrain cell types across different mouse models of Parkinson’s disease. | en |
| heal.advisorName | Κολοβός, Πέτρος | el |
| heal.committeeMemberName | Κολοβός, Πέτρος | el |
| heal.committeeMemberName | Παλαιολόγου, Αικατερίνη | el |
| heal.committeeMemberName | Γεωργίτση, Μαριάνθη | el |
| heal.committeeMemberName | Kolovos, Petros | en |
| heal.committeeMemberName | Palaiologou, Aikaterini | en |
| heal.committeeMemberName | Georgitsi, Marianthi | en |
| heal.academicPublisher | Τμήμα Μοριακής Βιολογίας και Γενετικής | el |
| heal.academicPublisherID | duth | en |
| heal.numberOfPages | 53 σ. | el |
| heal.fullTextAvailability | true | - |
| heal.type.en | Master thesis | en |
| heal.type.el | Μεταπτυχιακή εργασία | el |
| dc.contributor.master | Εφαρμοσμένη Βιοπληροφορική-Ανάλυση Βιολογικών Δεδομένων | el |
| Appears in Collections: | Π.Μ.Σ. ΕΦΑΡΜΟΣΜΕΝΗ ΒΙΟΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗ ΚΑΙ ΑΝΑΛΥΣΗ ΔΕΔΟΜΕΝΩΝ | |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| KaramitsouΚ_2026.pdf | Μεταπτυχιακή εργασία | 2.23 MB | Adobe PDF | View/Open Request a copy |
Please use this identifier to cite or link to this item:
This item is a favorite for 0 people.
https://repo.lib.duth.gr/jspui/handle/123456789/22642
http://dx.doi.org/10.26257/heal.duth.21316
This item is licensed under a Creative Commons License
